Audio zapisi tvore jedinstveni fundus folklorističkih i etnografskih dokumenata o hrvatskoj tradicijskoj kulturi, o drugim narodnostima u Hrvatskoj kao i o Hrvatima izvan Hrvatske, a pokrivaju područja usmene književnosti, folklorne glazbe i plesa, kazivanja o običajima i drugu etnološku građu te suvremena događanja, znanstvene skupove i drugo. U fonoteci je pohranjeno trenutno 3483 jedinica, a radi se uglavnom o zapisima s hrvatskog govornog područja. S digitalizacijom najstarijih magnetofonskih snimki započelo se 1997. i danas digitalni fonotečni fond broji 1131 jedinica digitalne građe koje datiraju od 1954. do 2010. godine.